現在的電泳漆涂料屬于環保涂料，減少了有機溶劑的使用，不含重金屬污染，再加上一般的槽液溫度控制在26-32℃，很容易為微生物細菌的繁殖提供理想的生長環境，因此
電泳漆微生物檢測與殺菌是很有必要的。因為當細菌進入電泳漆槽液中，電泳涂料水溶性的中和酸成分會被細菌作為營養物質吞噬，電泳槽的pH會持續升高，電導率急速下降，容易導致涂料穩定性降低而絮凝產生沉渣，陽極液水箱容易出現絮凝物，堵塞主循環和超濾循環系統設備，電泳涂膜出現顆粒、粗糙、失光等異常，危害相當大。
對此進行殺菌處理需要加強電泳生產規范管理即水的管理。消滅純水中細菌的常用方法如下：
在純水系統的送水口增加一套裝置來消滅細菌。具體的處理裝置有紫外線照射裝置、特種過濾裝置、氯化處理裝置、臭氧裝置。氯化處理較簡單便宜，而臭氧處理較復雜昂貴，四種方法中的每一種都能達到滅菌的效果。但是，若電泳漆生產線已經產生了細菌問題，用上述辦法則很難達到理想的效果了。考慮到對電泳漆液和電泳質量的影響，可以選擇在陽極系統中使用添加劑。
對于細菌開始滋生，長菌現象不嚴重可采取以下方案來處理：
1.人工清理管道、閥門等處的細菌污物，保證管路循環暢通。
2.排空極液槽內的極液，對槽壁、槽底等進行人工清理。
3.先打入部分純水，循環極管內的極液，把極液帶出，并全部排空。
4.極液箱注滿純水，加入約3-5%的殺菌劑。
5.循環清洗24小時以上，必要時人工對循環管路、槽壁等進行清理。
6.循環清洗結束后，排空循環液，人工清理極液槽底內的污物。
7.注滿純水，循環清洗1小時后排空。
8.再次注滿純水，用醋酸配制陽極液后正常生產。
9.建議每周進行一次清洗，并且送樣檢測細菌含量，制定實施周期。
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